深户与非深户在公司注册和交税方面有着显著的差别。在深圳，注册公司需要提交深户或者非深户的身份证明，如果是非深户，还需要提交与深圳有关的证明文件，比如深圳房产证、深圳社保证明等。此外，不同户籍的企业主，在交税方面也有不同的政策待遇。
首先，深户企业主可以享受到深圳市政府出台的多项优惠政策，比如减免税政策、获得人才专项扶持政策等。对于非深户企业主，则需要在缴税前先办理外地缴税转入深圳的手续。同时，对于非深户企业主而言，由于其户籍不在深圳，需要支付更高的社保费用，这也会对企业的经营造成影响。
其次，对于涉及到海关报关等业务的企业来说，深户企业主会有更为便捷的海关通关程序。在海关报关程序中，深户企业主不需要提交特殊的单证或者文件，而非深户则需要提交额外的证明文件，这会延长企业的海关通关时间和流程。
最后，对于在深圳注册的公司来说，如果公司的法人代表或者股东是深户，则公司的注册和审批手续会更加快捷和便利，这也为深户企业主带来了无形的优势和便利。
在办理深户方面，应届生、学历和职称几种方式可以选择。应届生只需要具备全日制专科及以上学历、身体健康的条件，就可以申请入户深圳。而对于已经有一定工作或学历背景的申请者，则可以选择学历或职称入户深圳。无论选择哪种方式，满足申请条件的人群都可以通过快捷的入户方式获得深圳户籍。当然，对于想要注册深圳公司的申请者来说，深户身份将会带来许多便利和优势。
总之，深户和非深户在企业注册和交税方面存在很大的差别。对于想要在深圳注册公司和发展事业的申请者来说，可以考虑办理深户身份，从而享受到更多的优惠政策和便利服务。